批量下载NCBI各种数据的方法集合

批量下载NCBI各种数据的方法集合

RNA-seq流程学习笔记(7)-使用Hisat2进行序列比对

SuAitong:

我比对后无报错,文件也正常输出了,输入文件和序列文件都没有问题,但比对结果就是0配比,只有某几个文件匹配上了一个,剩下全是0%。这种结果可能是什么原因呢?

RNA-seq流程学习笔记(15)-使用DESeq2进行差异基因分析

m0_64551430:

需要命令指定dds$condition <- factor(dds$condition, levels = c("untreated","treated")),否则按照字母顺序来比较

RNA-seq流程学习笔记(15)-使用DESeq2进行差异基因分析

m0_64551430:

需要命令指定dds$condition <- factor(dds$condition, levels = c("untreated","treated")),否则还是按照字母顺序来比较,也就是和作者写的一样

RNA-seq流程学习笔记(1)-Ubuntu系统安装SRA数据下载软件Aspera connect和SRT-Toolkit

dushubobi:

步骤6里面代码是不是错了,文件夹应该是“/.aspera/",少了一个.

RNA-seq流程学习笔记(15)-使用DESeq2进行差异基因分析

error_unexpected:

你好,差异分析两组比较的顺序不同,结果是不是也应该不同

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